Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRAGBQ5VZM2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRAGBQ5VZM2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms