Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf140Q5VVS0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf140Q5VVS0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1orf140Q5VVS0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
C1orf140Q5VVS0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C1orf140Q5VVS0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf140Q5VVS0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C1orf140Q5VVS0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf140Q5VVS0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf140Q5VVS0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf140Q5VVS0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf140Q5VVS0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf140Q5VVS0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf140Q5VVS0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf140Q5VVS0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf140Q5VVS0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf140Q5VVS0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf140Q5VVS0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf140Q5VVS0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf140Q5VVS0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C1orf140Q5VVS0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf140Q5VVS0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf140Q5VVS0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf140Q5VVS0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf140Q5VVS0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf140Q5VVS0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C1orf140Q5VVS0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms