Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF220Q5VTB9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF220Q5VTB9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms