Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIN9Q5TKA1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN9Q5TKA1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms