Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00242Q5T6M2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00242Q5T6M2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00242Q5T6M2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00242Q5T6M2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00242Q5T6M2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00242Q5T6M2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00242Q5T6M2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00242Q5T6M2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00242Q5T6M2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00242Q5T6M2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00242Q5T6M2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00242Q5T6M2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00242Q5T6M2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00242Q5T6M2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00242Q5T6M2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00242Q5T6M2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00242Q5T6M2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00242Q5T6M2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00242Q5T6M2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00242Q5T6M2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00242Q5T6M2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00242Q5T6M2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00242Q5T6M2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00242Q5T6M2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms