Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP100Q494V2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP100Q494V2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
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