Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF260Q3ZCT1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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