Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HLA-BQ31612 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HLA-BQ31612 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HLA-BQ31612 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HLA-BQ31612 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
HLA-BQ31612 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-BQ31612 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-BQ31612 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms