Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FHOD3Q2V2M9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
FHOD3Q2V2M9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC35.56■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC35.53■■■■□ 3.28
FHOD3Q2V2M9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms