Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VWC2Q2TAL6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VWC2Q2TAL6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms