Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NCOA1Q15788 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NCOA1Q15788 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NCOA1Q15788 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms