Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SIX1Q15475 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIX1Q15475 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms