Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK3Q15120 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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