Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PDCD1Q15116 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
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