Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCAPHQ15003 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NCAPHQ15003 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCAPHQ15003 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
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