Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF4BQ13523 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF4BQ13523 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
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