Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB3Q13509 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB3Q13509 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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