Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NR1H3Q13133 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1H3Q13133 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms