Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 KSH1YNL024C-A 219 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 DPM1YPR183W 804 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 GFA1YKL104C 2154 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 CCT3YJL014W 1605 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 CEM1YER061C 1329 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 PRP2YNR011C 2631 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 COX20YDR231C 618 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YER046W-AYER046W-A 330 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 ASG7YJL170C 630 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YMR084WYMR084W 789 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 snR30snR30 606 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 IRC5YFR038W 2562 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YEN1YER041W 2280 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YFL040WYFL040W 1623 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 AGE1YDR524C 1449 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 PEX31YGR004W 1389 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 ASN2YGR124W 1719 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 MIG3YER028C 1185 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 FUR1YHR128W 651 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YHR213WYHR213W 597 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YLR124WYLR124W 345 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YAR062WYAR062W 597 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YOR314WYOR314W 330 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 RPL43AYPR043W 279 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YER137C-AYER137C-A 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YER159C-AYER159C-A 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YJR026WYJR026W 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YJR028WYJR028W 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YAR010CYAR010C 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YML040WYML040W 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YML045W-AYML045W-A 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YMR051CYMR051C 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 ACO1YLR304C 2337 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 NFS1YCL017C 1494 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 STL1YDR536W 1710 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 CIR2YOR356W 1896 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 CHS5YLR330W 2016 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 CTA1YDR256C 1548 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 ZWF1YNL241C 1518 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YDL032WYDL032W 312 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 snR8snR8 190 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 KEI1YDR367W 666 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 THG1YGR024C 714 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 PET54YGR222W 882 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 IKI1YHR187W 930 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 MDE1YJR024C 735 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 SDO1YLR022C 753 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 FPR3YML074C 1236 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 MRPL17YNL252C 846 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 ATG3YNR007C 933 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YOL029CYOL029C 606 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 SFM1YOR021C 642 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 MBF1YOR298C-A 456 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YPL067CYPL067C 597 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 HBN1YCL026C-B 582 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YBR241CYBR241C 1467 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 YLL066CYLL066C 3618 nt6.21□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 DLD1YDL174C 1764 nt6.21□□□□□ -1.41
TY1A-BLQ12266 CTS2YDR371W 1536 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 MRPL28YDR462W 444 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 PDA1YER178W 1263 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 RPS20YHL015W 366 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 THR1YHR025W 1074 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 GVP36YIL041W 981 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 SDP1YIL113W 630 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YJL169WYJL169W 369 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 VPS71YML041C 843 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YNR071CYNR071C 1029 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YOL163WYOL163W 510 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 ECM23YPL021W 564 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 RPO26YPR187W 468 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 RPS9BYBR189W 588 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 ASM4YDL088C 1587 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 ORC4YPR162C 1590 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 COT1YOR316C 1320 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 MFB1YDR219C 1398 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 CYS3YAL012W 1185 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YAL045CYAL045C 309 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YPL073CYPL073C 486 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 YHR202WYHR202W 1809 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-BLQ12266 RAD30YDR419W 1899 nt6.19□□□□□ -1.42
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