Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 IME4YGL192W 1803 nt4.76□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 HMS1YOR032C 1305 nt4.76□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 HXT5YHR096C 1779 nt4.76□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 PEX19YDL065C 1029 nt4.76□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 RPS16BYDL083C 432 nt4.76□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 AAD4YDL243C 990 nt4.76□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 TMN2YDR107C 2019 nt4.76□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 RAD30YDR419W 1899 nt4.76□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 YAL064WYAL064W 285 nt4.76□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 PWP1YLR196W 1731 nt4.76□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 MAG2YLR427W 2013 nt4.76□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt4.76□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 RUF20RUF20 443 nt4.76□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 YOL107WYOL107W 1029 nt4.76□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 PEP4YPL154C 1218 nt4.76□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 SRB6YBR253W 366 nt4.76□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 GRX1YCL035C 333 nt4.76□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 APC4YDR118W 1959 nt4.76□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 YMR196WYMR196W 3267 nt4.76□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 PRO2YOR323C 1371 nt4.76□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 PMT5YDL093W 2232 nt4.76□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 EMP46YLR080W 1335 nt4.75□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 ZRC1YMR243C 1329 nt4.75□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 YHR182WYHR182W 2358 nt4.75□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 RIM15YFL033C 5313 nt4.75□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 RNH202YDR279W 1053 nt4.75□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 ACT1YFL039C 1128 nt4.75□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 YGL199CYGL199C 471 nt4.75□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 YGR015CYGR015C 987 nt4.75□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 DCD1YHR144C 939 nt4.75□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 SNL1YIL016W 480 nt4.75□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 CDC73YLR418C 1182 nt4.75□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 URA4YLR420W 1095 nt4.75□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 SAP30YMR263W 606 nt4.75□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 YNL303WYNL303W 348 nt4.75□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 CDC4YFL009W 2340 nt4.75□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 BUD14YAR014C 2130 nt4.75□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 RPN6YDL097C 1305 nt4.74□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 BUD8YLR353W 1812 nt4.74□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 ELP2YGR200C 2367 nt4.74□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt4.74□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 YGL218WYGL218W 651 nt4.74□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt4.74□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 RSM26YJR101W 801 nt4.74□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 ECM1YAL059W 639 nt4.74□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 SIC1YLR079W 855 nt4.74□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 YMR084WYMR084W 789 nt4.74□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 NRM1YNR009W 750 nt4.74□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 MVD1YNR043W 1191 nt4.74□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 ECM23YPL021W 564 nt4.74□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 NAT3YPR131C 588 nt4.74□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 UMP1YBR173C 447 nt4.74□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt4.74□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 BSD2YBR290W 966 nt4.74□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 RER1YCL001W 567 nt4.74□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 KAR2YJL034W 2049 nt4.73□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 SUP35YDR172W 2058 nt4.73□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 ARF2YDL137W 546 nt4.73□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 GIC2YDR309C 1152 nt4.73□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 ALB1YJL122W 528 nt4.73□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 RPL43BYJR094W-A 279 nt4.73□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 YLR042CYLR042C 486 nt4.73□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 YML094C-AYML094C-A 402 nt4.73□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 YNL217WYNL217W 981 nt4.73□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 SOL1YNR034W 966 nt4.73□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 AIF1YNR074C 1137 nt4.73□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 CIN5YOR028C 888 nt4.73□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 YOR062CYOR062C 807 nt4.73□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 snR189snR189 189 nt4.73□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 ECM8YBR076W 1065 nt4.73□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 YMD8YML038C 1329 nt4.72□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 RPL28YGL103W 450 nt4.72□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 ACP1YKL192C 378 nt4.72□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 YLR365WYLR365W 333 nt4.72□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 RGS2YOR107W 930 nt4.72□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 IAH1YOR126C 717 nt4.72□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 SUT2YPR009W 807 nt4.72□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 CBF5YLR175W 1452 nt4.72□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 IMD3YLR432W 1572 nt4.72□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 SEO1YAL067C 1782 nt4.72□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 GLT1YDL171C 6438 nt4.72□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 PDR10YOR328W 4695 nt4.72□□□□□ -1.65
LCB4Q12246 YDL012CYDL012C 324 nt4.71□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt4.71□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 NSE1YLR007W 1011 nt4.71□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 THI80YOR143C 960 nt4.71□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 RMI1YPL024W 726 nt4.71□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 YCL012CYCL012C 405 nt4.71□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 RTC5YOR118W 1704 nt4.71□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 TUL1YKL034W 2277 nt4.71□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 ALD3YMR169C 1521 nt4.71□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 ALD2YMR170C 1521 nt4.71□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 TUB3YML124C 1338 nt4.71□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 YJL206CYJL206C 2277 nt4.7□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 YEL067CYEL067C 588 nt4.7□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 LYS5YGL154C 819 nt4.7□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 SDT1YGL224C 843 nt4.7□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 MRPS35YGR165W 1038 nt4.7□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 TTI2YJR136C 1266 nt4.7□□□□□ -1.66
LCB4Q12246 YNK1YKL067W 462 nt4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.7 ms