Protein–RNA interactions for Protein: Q12158

MCD1, Sister chromatid cohesion protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCD1Q12158 YEL010WYEL010W 351 nt5.8□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 PRP38YGR075C 729 nt5.8□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.8□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.8□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.8□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.8□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 COS8YHL048W 1146 nt5.8□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.8□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 CAB2YIL083C 1098 nt5.8□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 JLP1YLL057C 1239 nt5.8□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 REC102YLR329W 795 nt5.8□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.8□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 TRI1YMR233W 681 nt5.8□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 RPC34YNR003C 954 nt5.8□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 snR11snR11 258 nt5.8□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 MUD1YBR119W 897 nt5.8□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 VPS5YOR069W 2028 nt5.8□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 YHR202WYHR202W 1809 nt5.8□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 GAS3YMR215W 1575 nt5.8□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 PST1YDR055W 1335 nt5.79□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 RCK2YLR248W 1833 nt5.79□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 RAD53YPL153C 2466 nt5.79□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 URA3YEL021W 804 nt5.79□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 YGL214WYGL214W 486 nt5.79□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.79□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.79□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.79□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 SPO7YAL009W 780 nt5.79□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 RHO4YKR055W 876 nt5.79□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 YOR314WYOR314W 330 nt5.79□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 ATG5YPL149W 885 nt5.79□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 YPR177CYPR177C 372 nt5.79□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 ERT1YBR239C 1590 nt5.79□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 ADE12YNL220W 1302 nt5.78□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 MCM3YEL032W 2916 nt5.78□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 YFH7YFR007W 1062 nt5.78□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 YGL204CYGL204C 306 nt5.78□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 PRP18YGR006W 756 nt5.78□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 BET1YIL004C 429 nt5.78□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 COS9YKL219W 1224 nt5.78□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 YLR317WYLR317W 435 nt5.78□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 INP1YMR204C 1263 nt5.78□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 MAP2YBL091C 1266 nt5.78□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 SMF1YOL122C 1728 nt5.78□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 MIC60YKR016W 1623 nt5.77□□□□□ -1.48
MCD1Q12158 POL31YJR006W 1464 nt5.77□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 MCM6YGL201C 3054 nt5.77□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 YER186CYER186C 921 nt5.77□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 NPY1YGL067W 1155 nt5.77□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 YLR456WYLR456W 615 nt5.77□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 MRPL16YBL038W 699 nt5.77□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 ARR3YPR201W 1215 nt5.77□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 CNE1YAL058W 1509 nt5.77□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 GPA2YER020W 1350 nt5.77□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 ACC1YNR016C 6702 nt5.76□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 MAL12YGR292W 1755 nt5.76□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 MAL32YBR299W 1755 nt5.76□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 YER133W-AYER133W-A 342 nt5.76□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 YHR127WYHR127W 732 nt5.76□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt5.76□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 GCD7YLR291C 1146 nt5.76□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 MRPL17YNL252C 846 nt5.76□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 ARG1YOL058W 1263 nt5.76□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 PTK2YJR059W 2457 nt5.75□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 CTF13YMR094W 1437 nt5.75□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 FPK1YNR047W 2682 nt5.75□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 ERJ5YFR041C 888 nt5.75□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 ECM19YLR390W 339 nt5.75□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt5.75□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 YIG1YPL201C 1386 nt5.75□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 CLB2YPR119W 1476 nt5.75□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 YTA12YMR089C 2478 nt5.74□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 DBF2YGR092W 1719 nt5.74□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 UTP5YDR398W 1932 nt5.74□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 HSP104YLL026W 2727 nt5.74□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 SHU2YDR078C 672 nt5.74□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 PRE1YER012W 597 nt5.74□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 GLE2YER107C 1098 nt5.74□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 EGD2YHR193C 525 nt5.74□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 YJU3YKL094W 942 nt5.74□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt5.74□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 AMA1YGR225W 1782 nt5.74□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 RTK1YDL025C 1863 nt5.74□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 YFL042CYFL042C 2025 nt5.74□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 MMT1YMR177W 1533 nt5.74□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 TIM54YJL054W 1437 nt5.74□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 HXT5YHR096C 1779 nt5.73□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 ARG4YHR018C 1392 nt5.73□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 YCL076WYCL076W 744 nt5.73□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 YDL144CYDL144C 1071 nt5.73□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 PET100YDR079W 336 nt5.73□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 DJP1YIR004W 1299 nt5.73□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 YLR126CYLR126C 756 nt5.73□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 CKA2YOR061W 1020 nt5.73□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 PNG1YPL096W 1092 nt5.73□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 MIG1YGL035C 1515 nt5.73□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 NOP58YOR310C 1536 nt5.73□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 PRO2YOR323C 1371 nt5.72□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 HTB1YDR224C 396 nt5.72□□□□□ -1.49
MCD1Q12158 DAM1YGR113W 1032 nt5.72□□□□□ -1.49
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