Protein–RNA interactions for Protein: Q11206

ST3GAL4, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL4Q11206 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL4Q11206 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL4Q11206 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL4Q11206 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL4Q11206 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ST3GAL4Q11206 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ST3GAL4Q11206 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ST3GAL4Q11206 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ST3GAL4Q11206 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ST3GAL4Q11206 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ST3GAL4Q11206 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ST3GAL4Q11206 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ST3GAL4Q11206 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ST3GAL4Q11206 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ST3GAL4Q11206 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ST3GAL4Q11206 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ST3GAL4Q11206 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms