Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LOXL1Q08397 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LOXL1Q08397 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LOXL1Q08397 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LOXL1Q08397 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXL1Q08397 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXL1Q08397 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXL1Q08397 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXL1Q08397 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXL1Q08397 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXL1Q08397 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXL1Q08397 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXL1Q08397 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXL1Q08397 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXL1Q08397 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LOXL1Q08397 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.4 ms