Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LRP1Q07954 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LRP1Q07954 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms