Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CKAP4Q07065 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKAP4Q07065 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms