Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 LSC1YOR142W 990 nt6.43□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 RIB5YBR256C 717 nt6.43□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 ZRC1YMR243C 1329 nt6.43□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 XBP1YIL101C 1944 nt6.42□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 PMP3YDR276C 168 nt6.42□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 MRPL35YDR322W 1104 nt6.42□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 RPF1YHR088W 888 nt6.42□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt6.42□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 SEC17YBL050W 879 nt6.42□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 MAP2YBL091C 1266 nt6.42□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 RRG7YOR305W 729 nt6.42□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 TIP20YGL145W 2106 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 NOP8YOL144W 1455 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 YMR155WYMR155W 1644 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 DTD1YDL219W 453 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 QCR6YFR033C 444 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 YHR127WYHR127W 732 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 SFT1YKL006C-A 294 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 YAR064WYAR064W 300 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 TOA1YOR194C 861 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 MEI5YPL121C 669 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 IRS4YKR019C 1848 nt6.41□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 FET4YMR319C 1659 nt6.4□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 RCR2YDR003W 633 nt6.4□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 FAL1YDR021W 1200 nt6.4□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 RUB1YDR139C 234 nt6.4□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt6.4□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 YMR099CYMR099C 894 nt6.4□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 COS1YNL336W 1146 nt6.4□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 ATG5YPL149W 885 nt6.4□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 ALG14YBR070C 714 nt6.4□□□□□ -1.38
HDA3Q06623 PCL8YPL219W 1479 nt6.4□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 NOC4YPR144C 1659 nt6.39□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 AVO1YOL078W 3531 nt6.39□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 PRP18YGR006W 756 nt6.39□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 IKI1YHR187W 930 nt6.39□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 CYC1YJR048W 330 nt6.39□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 YKL023WYKL023W 834 nt6.39□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 POM33YLL023C 840 nt6.39□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 YLR217WYLR217W 324 nt6.39□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 RNA1YMR235C 1224 nt6.39□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 PRY3YJL078C 2646 nt6.38□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 YDR391CYDR391C 699 nt6.38□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 LCL3YGL085W 825 nt6.38□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 YGL138CYGL138C 1038 nt6.38□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 LYS5YGL154C 819 nt6.38□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 ARC15YIL062C 465 nt6.38□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 ASF1YJL115W 840 nt6.38□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 AIM24YJR080C 1185 nt6.38□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 YPT52YKR014C 705 nt6.38□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 SSO2YMR183C 888 nt6.38□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 PRM3YPL192C 402 nt6.38□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 SHE3YBR130C 1278 nt6.38□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 IDS2YJL146W 1410 nt6.38□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 YGL176CYGL176C 1665 nt6.38□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 YIL067CYIL067C 2037 nt6.38□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 NGR1YBR212W 2019 nt6.37□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 TDA6YPR157W 1404 nt6.37□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 ERP3YDL018C 678 nt6.37□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 YDR018CYDR018C 1191 nt6.37□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 YDR248CYDR248C 582 nt6.37□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 LYS1YIR034C 1122 nt6.37□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 DCN1YLR128W 810 nt6.37□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 MPD2YOL088C 834 nt6.37□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 RIB4YOL143C 510 nt6.37□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 YDR444WYDR444W 2064 nt6.37□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 AI4Q0065 1671 nt6.36□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 VPS30YPL120W 1674 nt6.36□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 FPR2YDR519W 408 nt6.36□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 SNO3YFL060C 669 nt6.36□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt6.36□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 ELO3YLR372W 1038 nt6.36□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 YNL058CYNL058C 951 nt6.36□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 NIS1YNL078W 1224 nt6.36□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 RUF23RUF23 254 nt6.36□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 SNO2YNL334C 669 nt6.36□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 CUE5YOR042W 1236 nt6.36□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 CTF19YPL018W 1110 nt6.36□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 snR3snR3 194 nt6.36□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 YCL002CYCL002C 792 nt6.36□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 MAL12YGR292W 1755 nt6.36□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 MAL32YBR299W 1755 nt6.36□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 EKI1YDR147W 1605 nt6.36□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 NTE1YML059C 5040 nt6.35□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 STP4YDL048C 1473 nt6.35□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 KRE29YER038C 1395 nt6.35□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 ERG8YMR220W 1356 nt6.35□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 ASA1YPR085C 1332 nt6.35□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 IMG1YCR046C 510 nt6.35□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 UBC9YDL064W 474 nt6.35□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 GRX3YDR098C 858 nt6.35□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 VMA3YEL027W 483 nt6.35□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 YGL242CYGL242C 546 nt6.35□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 SNX4YJL036W 1272 nt6.35□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 IRC19YLL033W 693 nt6.35□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt6.35□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 COQ3YOL096C 939 nt6.35□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 RKI1YOR095C 777 nt6.35□□□□□ -1.39
HDA3Q06623 KAR4YCL055W 1008 nt6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.8 ms