Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRB3Q04118 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRB3Q04118 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms