Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TAP1Q03518 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAP1Q03518 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms