Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFAIP2Q03169 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP2Q03169 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms