Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC25A11Q02978 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A11Q02978 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms