Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IFITM3Q01628 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IFITM3Q01628 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms