Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIM1P81133 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIM1P81133 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIM1P81133 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIM1P81133 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIM1P81133 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIM1P81133 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIM1P81133 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIM1P81133 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIM1P81133 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIM1P81133 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SIM1P81133 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIM1P81133 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIM1P81133 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIM1P81133 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SIM1P81133 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIM1P81133 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIM1P81133 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIM1P81133 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIM1P81133 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIM1P81133 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SIM1P81133 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIM1P81133 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIM1P81133 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIM1P81133 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIM1P81133 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIM1P81133 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIM1P81133 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIM1P81133 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIM1P81133 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIM1P81133 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIM1P81133 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIM1P81133 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SIM1P81133 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SIM1P81133 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIM1P81133 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIM1P81133 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SIM1P81133 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIM1P81133 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIM1P81133 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIM1P81133 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIM1P81133 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIM1P81133 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIM1P81133 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIM1P81133 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIM1P81133 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIM1P81133 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIM1P81133 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIM1P81133 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIM1P81133 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIM1P81133 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIM1P81133 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIM1P81133 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SIM1P81133 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIM1P81133 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SIM1P81133 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIM1P81133 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIM1P81133 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIM1P81133 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIM1P81133 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIM1P81133 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIM1P81133 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIM1P81133 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIM1P81133 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIM1P81133 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIM1P81133 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIM1P81133 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIM1P81133 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIM1P81133 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIM1P81133 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SIM1P81133 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SIM1P81133 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SIM1P81133 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIM1P81133 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIM1P81133 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIM1P81133 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIM1P81133 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIM1P81133 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIM1P81133 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIM1P81133 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SIM1P81133 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIM1P81133 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIM1P81133 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIM1P81133 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIM1P81133 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIM1P81133 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIM1P81133 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIM1P81133 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIM1P81133 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIM1P81133 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIM1P81133 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIM1P81133 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIM1P81133 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIM1P81133 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIM1P81133 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIM1P81133 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SIM1P81133 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIM1P81133 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIM1P81133 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIM1P81133 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms