Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NUCB2P80303 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUCB2P80303 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NUCB2P80303 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms