Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC5P78333 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC5P78333 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC5P78333 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC5P78333 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC5P78333 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC5P78333 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC5P78333 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC5P78333 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC5P78333 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC5P78333 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC5P78333 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC5P78333 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC5P78333 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC5P78333 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC5P78333 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC5P78333 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC5P78333 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC5P78333 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC5P78333 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC5P78333 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC5P78333 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC5P78333 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC5P78333 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPC5P78333 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPC5P78333 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPC5P78333 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC5P78333 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC5P78333 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC5P78333 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC5P78333 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC5P78333 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC5P78333 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC5P78333 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC5P78333 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC5P78333 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC5P78333 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC5P78333 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC5P78333 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC5P78333 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC5P78333 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC5P78333 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC5P78333 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC5P78333 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC5P78333 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC5P78333 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC5P78333 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC5P78333 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC5P78333 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC5P78333 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC5P78333 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC5P78333 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC5P78333 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC5P78333 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC5P78333 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC5P78333 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC5P78333 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC5P78333 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC5P78333 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC5P78333 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC5P78333 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC5P78333 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC5P78333 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC5P78333 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC5P78333 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC5P78333 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC5P78333 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC5P78333 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC5P78333 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC5P78333 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC5P78333 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC5P78333 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC5P78333 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC5P78333 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC5P78333 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC5P78333 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC5P78333 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC5P78333 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC5P78333 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC5P78333 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC5P78333 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC5P78333 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC5P78333 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC5P78333 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC5P78333 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC5P78333 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC5P78333 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC5P78333 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC5P78333 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC5P78333 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC5P78333 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC5P78333 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC5P78333 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC5P78333 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC5P78333 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC5P78333 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC5P78333 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC5P78333 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC5P78333 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GPC5P78333 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms