Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBB4BP68371 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms