Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SNRPNP63162 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNRPNP63162 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms