Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP46P62068 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP46P62068 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP46P62068 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP46P62068 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP46P62068 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP46P62068 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP46P62068 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP46P62068 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP46P62068 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP46P62068 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP46P62068 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
USP46P62068 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP46P62068 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP46P62068 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP46P62068 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP46P62068 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP46P62068 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP46P62068 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP46P62068 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP46P62068 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP46P62068 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP46P62068 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP46P62068 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP46P62068 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP46P62068 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP46P62068 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP46P62068 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP46P62068 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP46P62068 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP46P62068 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP46P62068 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP46P62068 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP46P62068 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP46P62068 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP46P62068 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP46P62068 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP46P62068 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP46P62068 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP46P62068 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP46P62068 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP46P62068 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP46P62068 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP46P62068 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP46P62068 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP46P62068 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP46P62068 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP46P62068 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP46P62068 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP46P62068 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP46P62068 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP46P62068 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP46P62068 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP46P62068 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP46P62068 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP46P62068 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP46P62068 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP46P62068 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP46P62068 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP46P62068 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP46P62068 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP46P62068 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP46P62068 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP46P62068 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP46P62068 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP46P62068 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP46P62068 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP46P62068 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP46P62068 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP46P62068 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP46P62068 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP46P62068 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP46P62068 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP46P62068 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP46P62068 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP46P62068 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP46P62068 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP46P62068 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP46P62068 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP46P62068 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP46P62068 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP46P62068 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP46P62068 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP46P62068 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP46P62068 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP46P62068 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP46P62068 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP46P62068 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP46P62068 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP46P62068 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP46P62068 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP46P62068 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP46P62068 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP46P62068 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP46P62068 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP46P62068 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP46P62068 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP46P62068 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP46P62068 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP46P62068 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms