Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTBP60709 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTBP60709 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTBP60709 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTBP60709 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTBP60709 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTBP60709 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTBP60709 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTBP60709 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTBP60709 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTBP60709 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTBP60709 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTBP60709 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTBP60709 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTBP60709 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTBP60709 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTBP60709 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTBP60709 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTBP60709 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTBP60709 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTBP60709 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTBP60709 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTBP60709 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTBP60709 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTBP60709 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTBP60709 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTBP60709 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTBP60709 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTBP60709 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTBP60709 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTBP60709 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTBP60709 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTBP60709 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTBP60709 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTBP60709 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTBP60709 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTBP60709 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTBP60709 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTBP60709 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTBP60709 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTBP60709 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTBP60709 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTBP60709 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTBP60709 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTBP60709 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTBP60709 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTBP60709 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTBP60709 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTBP60709 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTBP60709 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTBP60709 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTBP60709 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTBP60709 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTBP60709 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTBP60709 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTBP60709 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTBP60709 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTBP60709 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTBP60709 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTBP60709 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTBP60709 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTBP60709 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTBP60709 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTBP60709 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTBP60709 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTBP60709 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTBP60709 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTBP60709 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTBP60709 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTBP60709 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTBP60709 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTBP60709 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTBP60709 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTBP60709 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTBP60709 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTBP60709 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTBP60709 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTBP60709 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTBP60709 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTBP60709 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTBP60709 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTBP60709 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTBP60709 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTBP60709 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTBP60709 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTBP60709 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTBP60709 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTBP60709 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTBP60709 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTBP60709 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTBP60709 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTBP60709 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTBP60709 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTBP60709 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTBP60709 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTBP60709 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTBP60709 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTBP60709 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTBP60709 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTBP60709 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms