Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX9P55771 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX9P55771 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX9P55771 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX9P55771 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX9P55771 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX9P55771 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX9P55771 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PAX9P55771 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PAX9P55771 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PAX9P55771 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX9P55771 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX9P55771 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX9P55771 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX9P55771 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX9P55771 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX9P55771 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX9P55771 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX9P55771 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX9P55771 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX9P55771 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX9P55771 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX9P55771 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX9P55771 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PAX9P55771 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX9P55771 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX9P55771 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX9P55771 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX9P55771 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX9P55771 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX9P55771 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX9P55771 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX9P55771 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX9P55771 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX9P55771 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX9P55771 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAX9P55771 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX9P55771 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX9P55771 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX9P55771 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX9P55771 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX9P55771 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX9P55771 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX9P55771 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX9P55771 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PAX9P55771 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX9P55771 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX9P55771 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX9P55771 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX9P55771 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX9P55771 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX9P55771 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX9P55771 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX9P55771 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX9P55771 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX9P55771 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAX9P55771 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX9P55771 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX9P55771 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX9P55771 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX9P55771 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX9P55771 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX9P55771 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX9P55771 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PAX9P55771 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX9P55771 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX9P55771 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX9P55771 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX9P55771 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX9P55771 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX9P55771 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX9P55771 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX9P55771 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PAX9P55771 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX9P55771 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX9P55771 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX9P55771 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX9P55771 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX9P55771 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX9P55771 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX9P55771 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX9P55771 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX9P55771 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX9P55771 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PAX9P55771 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX9P55771 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX9P55771 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX9P55771 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX9P55771 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX9P55771 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX9P55771 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX9P55771 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX9P55771 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX9P55771 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX9P55771 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX9P55771 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX9P55771 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAX9P55771 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX9P55771 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAX9P55771 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms