Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL21P46778 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL21P46778 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL21P46778 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL21P46778 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL21P46778 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL21P46778 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL21P46778 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL21P46778 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL21P46778 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL21P46778 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL21P46778 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL21P46778 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL21P46778 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL21P46778 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL21P46778 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL21P46778 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL21P46778 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL21P46778 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL21P46778 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPL21P46778 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL21P46778 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL21P46778 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL21P46778 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL21P46778 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL21P46778 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL21P46778 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL21P46778 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL21P46778 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL21P46778 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL21P46778 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL21P46778 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL21P46778 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL21P46778 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL21P46778 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL21P46778 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL21P46778 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL21P46778 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL21P46778 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL21P46778 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL21P46778 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL21P46778 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL21P46778 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL21P46778 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL21P46778 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL21P46778 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL21P46778 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL21P46778 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL21P46778 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL21P46778 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL21P46778 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL21P46778 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL21P46778 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL21P46778 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL21P46778 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL21P46778 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL21P46778 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL21P46778 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL21P46778 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL21P46778 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL21P46778 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL21P46778 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL21P46778 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL21P46778 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL21P46778 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL21P46778 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL21P46778 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL21P46778 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL21P46778 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL21P46778 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL21P46778 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL21P46778 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL21P46778 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL21P46778 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL21P46778 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL21P46778 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL21P46778 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL21P46778 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL21P46778 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RPL21P46778 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL21P46778 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL21P46778 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL21P46778 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL21P46778 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL21P46778 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL21P46778 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL21P46778 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL21P46778 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL21P46778 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL21P46778 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL21P46778 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPL21P46778 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPL21P46778 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPL21P46778 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPL21P46778 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPL21P46778 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL21P46778 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL21P46778 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL21P46778 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL21P46778 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms