Protein–RNA interactions for Protein: P42843

SKP2, F-box protein SKP2, yeast

Predictions only

Length 763 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKP2	P42843	CBF5	YLR175W	1452 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	CLN2	YPL256C	1638 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YCR099C	YCR099C	468 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YER085C	YER085C	522 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YMR084W	YMR084W	789 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	BSD2	YBR290W	966 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	OCA5	YHL029C	2040 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	ASK10	YGR097W	3441 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	STB2	YMR053C	2553 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YDR098C-A	YDR098C-A	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YDR210C-C	YDR210C-C	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YDR261C-C	YDR261C-C	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YDR316W-A	YDR316W-A	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YDR365W-A	YDR365W-A	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YER137C-A	YER137C-A	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YER159C-A	YER159C-A	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YGR027W-A	YGR027W-A	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YGR038C-A	YGR038C-A	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YGR161C-C	YGR161C-C	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YJR026W	YJR026W	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YJR028W	YJR028W	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YAR010C	YAR010C	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YLR157C-A	YLR157C-A	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YLR227W-A	YLR227W-A	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YLR256W-A	YLR256W-A	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YML040W	YML040W	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YML045W-A	YML045W-A	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YMR051C	YMR051C	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YNL054W-A	YNL054W-A	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YOL103W-A	YOL103W-A	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YPL257W-A	YPL257W-A	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YPR137C-A	YPR137C-A	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YPR158C-C	YPR158C-C	1323 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	CPS1	YJL172W	1731 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YDR444W	YDR444W	2064 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	FAA3	YIL009W	2085 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	ALG9	YNL219C	1668 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YGL258W-A	YGL258W-A	234 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	BUD22	YMR014W	1560 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	FRE3	YOR381W	2136 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	PRD1	YCL057W	2139 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	HIS4	YCL030C	2400 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	TGL4	YKR089C	2733 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YGL152C	YGL152C	678 nt		4.93	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YHR112C	YHR112C	1137 nt		4.93	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	DID4	YKL002W	699 nt		4.93	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	NNK1	YKL171W	2787 nt		4.93	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YLR049C	YLR049C	1287 nt		4.93	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	RSF1	YMR030W	1131 nt		4.93	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	MDY2	YOL111C	639 nt		4.93	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	VPS68	YOL129W	555 nt		4.93	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	TRS33	YOR115C	807 nt		4.93	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	HXT14	YNL318C	1623 nt		4.93	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	GPR1	YDL035C	2886 nt		4.93	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	TUB3	YML124C	1338 nt		4.93	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	SKM1	YOL113W	1968 nt		4.93	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	GGA1	YDR358W	1674 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YMR196W	YMR196W	3267 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	TMN2	YDR107C	2019 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	SYP1	YCR030C	2613 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	TCA17	YEL048C	459 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	ARI1	YGL157W	1044 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YGR219W	YGR219W	342 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	snR10	snR10	245 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	EFM2	YBR271W	1260 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	ALG6	YOR002W	1635 nt		4.92	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	MOT2	YER068W	1764 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	TSL1	YML100W	3297 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	ABF1	YKL112W	2196 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	ADY3	YDL239C	2373 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YCR016W	YCR016W	873 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	BUD30	YDL151C	582 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	DPB4	YDR121W	591 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	ECT1	YGR007W	972 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YGR153W	YGR153W	654 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	tR(UCU)Q1	tR(UCU)Q1	73 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	PPE1	YHR075C	1203 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	LAC1	YKL008C	1257 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YKL071W	YKL071W	771 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	YLR125W	YLR125W	411 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	TIS11	YLR136C	858 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	CDC73	YLR418C	1182 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	RAD10	YML095C	633 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	SEC65	YML105C	822 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	ATG19	YOL082W	1248 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	TFB6	YOR352W	1032 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	SIP5	YMR140W	1470 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	RRI1	YDL216C	1323 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	GAD1	YMR250W	1758 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	PHO90	YJL198W	2646 nt		4.91	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	ROT2	YBR229C	2865 nt		4.9	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	SUP35	YDR172W	2058 nt		4.9	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	GDH2	YDL215C	3279 nt		4.9	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	GAS5	YOL030W	1455 nt		4.9	□□□□□ -1.62
SKP2	P42843	COQ4	YDR204W	1008 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	RPB7	YDR404C	516 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	YDR417C	YDR417C	372 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	FSH1	YHR049W	732 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	YIP3	YNL044W	531 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	GLO4	YOR040W	858 nt		4.9	□□□□□ -1.63

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