Protein–RNA interactions for Protein: P41271

NBL1, Neuroblastoma suppressor of tumorigenicity 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBL1P41271 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBL1P41271 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBL1P41271 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBL1P41271 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBL1P41271 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBL1P41271 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBL1P41271 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBL1P41271 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBL1P41271 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBL1P41271 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBL1P41271 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBL1P41271 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBL1P41271 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NBL1P41271 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBL1P41271 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBL1P41271 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBL1P41271 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBL1P41271 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBL1P41271 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBL1P41271 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBL1P41271 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBL1P41271 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBL1P41271 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBL1P41271 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBL1P41271 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBL1P41271 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBL1P41271 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NBL1P41271 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBL1P41271 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBL1P41271 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBL1P41271 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBL1P41271 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBL1P41271 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBL1P41271 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBL1P41271 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBL1P41271 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBL1P41271 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBL1P41271 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NBL1P41271 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBL1P41271 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBL1P41271 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBL1P41271 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBL1P41271 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBL1P41271 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBL1P41271 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBL1P41271 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBL1P41271 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBL1P41271 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBL1P41271 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBL1P41271 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBL1P41271 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBL1P41271 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBL1P41271 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NBL1P41271 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBL1P41271 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBL1P41271 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBL1P41271 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBL1P41271 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBL1P41271 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBL1P41271 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBL1P41271 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBL1P41271 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBL1P41271 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBL1P41271 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBL1P41271 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBL1P41271 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBL1P41271 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBL1P41271 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NBL1P41271 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBL1P41271 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBL1P41271 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBL1P41271 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBL1P41271 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBL1P41271 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBL1P41271 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBL1P41271 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBL1P41271 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NBL1P41271 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBL1P41271 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NBL1P41271 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBL1P41271 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NBL1P41271 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NBL1P41271 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBL1P41271 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBL1P41271 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBL1P41271 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NBL1P41271 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBL1P41271 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NBL1P41271 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBL1P41271 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBL1P41271 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBL1P41271 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBL1P41271 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBL1P41271 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBL1P41271 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBL1P41271 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBL1P41271 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBL1P41271 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBL1P41271 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBL1P41271 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms