Protein–RNA interactions for Protein: P41240

CSK, Tyrosine-protein kinase CSK, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSKP41240 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSKP41240 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSKP41240 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSKP41240 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSKP41240 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CSKP41240 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSKP41240 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSKP41240 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CSKP41240 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSKP41240 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSKP41240 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSKP41240 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSKP41240 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSKP41240 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSKP41240 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSKP41240 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSKP41240 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSKP41240 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSKP41240 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSKP41240 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSKP41240 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSKP41240 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSKP41240 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSKP41240 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSKP41240 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSKP41240 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSKP41240 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSKP41240 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSKP41240 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSKP41240 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSKP41240 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSKP41240 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSKP41240 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSKP41240 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSKP41240 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSKP41240 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSKP41240 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSKP41240 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSKP41240 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSKP41240 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSKP41240 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSKP41240 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSKP41240 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSKP41240 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSKP41240 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSKP41240 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSKP41240 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSKP41240 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSKP41240 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSKP41240 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSKP41240 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSKP41240 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSKP41240 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSKP41240 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSKP41240 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSKP41240 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSKP41240 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSKP41240 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSKP41240 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSKP41240 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSKP41240 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSKP41240 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSKP41240 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSKP41240 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSKP41240 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSKP41240 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSKP41240 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSKP41240 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSKP41240 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSKP41240 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSKP41240 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSKP41240 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSKP41240 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSKP41240 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSKP41240 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSKP41240 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSKP41240 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSKP41240 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSKP41240 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSKP41240 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSKP41240 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSKP41240 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSKP41240 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSKP41240 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSKP41240 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSKP41240 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSKP41240 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSKP41240 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSKP41240 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSKP41240 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSKP41240 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSKP41240 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSKP41240 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSKP41240 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSKP41240 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSKP41240 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSKP41240 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSKP41240 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSKP41240 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSKP41240 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms