Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THPOP40225 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THPOP40225 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
THPOP40225 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THPOP40225 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THPOP40225 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THPOP40225 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THPOP40225 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THPOP40225 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THPOP40225 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THPOP40225 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THPOP40225 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
THPOP40225 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THPOP40225 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THPOP40225 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
THPOP40225 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THPOP40225 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THPOP40225 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THPOP40225 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THPOP40225 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THPOP40225 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THPOP40225 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
THPOP40225 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
THPOP40225 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
THPOP40225 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THPOP40225 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THPOP40225 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THPOP40225 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THPOP40225 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THPOP40225 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THPOP40225 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THPOP40225 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THPOP40225 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THPOP40225 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
THPOP40225 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
THPOP40225 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
THPOP40225 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
THPOP40225 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
THPOP40225 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
THPOP40225 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THPOP40225 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THPOP40225 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THPOP40225 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THPOP40225 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THPOP40225 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THPOP40225 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THPOP40225 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THPOP40225 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THPOP40225 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
THPOP40225 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
THPOP40225 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
THPOP40225 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THPOP40225 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THPOP40225 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
THPOP40225 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THPOP40225 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THPOP40225 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
THPOP40225 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THPOP40225 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THPOP40225 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THPOP40225 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
THPOP40225 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
THPOP40225 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
THPOP40225 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THPOP40225 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THPOP40225 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THPOP40225 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THPOP40225 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THPOP40225 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THPOP40225 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THPOP40225 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THPOP40225 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THPOP40225 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THPOP40225 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
THPOP40225 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THPOP40225 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THPOP40225 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THPOP40225 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
THPOP40225 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THPOP40225 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THPOP40225 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THPOP40225 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THPOP40225 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THPOP40225 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THPOP40225 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THPOP40225 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THPOP40225 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THPOP40225 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THPOP40225 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THPOP40225 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THPOP40225 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THPOP40225 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THPOP40225 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THPOP40225 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THPOP40225 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
THPOP40225 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THPOP40225 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THPOP40225 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
THPOP40225 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THPOP40225 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms