Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXD12P35452 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD12P35452 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms