Protein–RNA interactions for Protein: P33121

ACSL1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL1P33121 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL1P33121 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL1P33121 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms