Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DSG3P32926 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DSG3P32926 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DSG3P32926 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DSG3P32926 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DSG3P32926 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DSG3P32926 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DSG3P32926 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DSG3P32926 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DSG3P32926 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSG3P32926 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSG3P32926 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSG3P32926 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSG3P32926 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSG3P32926 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSG3P32926 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSG3P32926 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSG3P32926 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSG3P32926 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSG3P32926 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSG3P32926 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DSG3P32926 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DSG3P32926 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSG3P32926 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSG3P32926 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSG3P32926 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DSG3P32926 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DSG3P32926 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DSG3P32926 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSG3P32926 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSG3P32926 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSG3P32926 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSG3P32926 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DSG3P32926 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSG3P32926 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSG3P32926 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DSG3P32926 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSG3P32926 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DSG3P32926 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSG3P32926 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSG3P32926 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSG3P32926 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSG3P32926 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG3P32926 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG3P32926 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG3P32926 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG3P32926 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG3P32926 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG3P32926 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG3P32926 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG3P32926 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG3P32926 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG3P32926 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG3P32926 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG3P32926 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG3P32926 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG3P32926 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG3P32926 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG3P32926 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG3P32926 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG3P32926 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSG3P32926 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG3P32926 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG3P32926 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG3P32926 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG3P32926 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG3P32926 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG3P32926 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG3P32926 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG3P32926 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG3P32926 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG3P32926 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG3P32926 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG3P32926 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG3P32926 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG3P32926 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG3P32926 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSG3P32926 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DSG3P32926 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSG3P32926 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSG3P32926 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSG3P32926 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSG3P32926 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSG3P32926 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSG3P32926 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSG3P32926 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSG3P32926 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSG3P32926 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSG3P32926 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSG3P32926 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSG3P32926 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSG3P32926 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSG3P32926 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSG3P32926 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSG3P32926 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSG3P32926 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG3P32926 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG3P32926 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG3P32926 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSG3P32926 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms