Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	CUS2	YNL286W	858 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	REX4	YOL080C	870 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	YOR097C	YOR097C	528 nt		4.55	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	SNT2	YGL131C	4212 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	VHC1	YBR235W	3363 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	AXL2	YIL140W	2472 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	SPR28	YDR218C	1272 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	SPS19	YNL202W	879 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	CSL4	YNL232W	879 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	TAF3	YPL011C	1062 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	ENV7	YPL236C	1095 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	PEX29	YDR479C	1665 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	DOA1	YKL213C	2148 nt		4.54	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	DNF2	YDR093W	4839 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	PRO2	YOR323C	1371 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	CUE2	YKL090W	1332 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	RPL28	YGL103W	450 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	MOG1	YJR074W	657 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	YAL069W	YAL069W	315 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	YNL303W	YNL303W	348 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	AIF1	YNR074C	1137 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	PNO1	YOR145C	825 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	HAT1	YPL001W	1125 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	RER1	YCL001W	567 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	TGL4	YKR089C	2733 nt		4.53	□□□□□ -1.68
SIP1	P32578	CPS1	YJL172W	1731 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	MMT1	YMR177W	1533 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	SFI1	YLL003W	2841 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	TRE1	YPL176C	2352 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	MHF2	YDL160C-A	243 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	SUR2	YDR297W	1050 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	YER067C-A	YER067C-A	324 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	PEX14	YGL153W	1026 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	CMC1	YKL137W	336 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	GSP1	YLR293C	660 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	PRM4	YPL156C	855 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	snR17b	snR17b	332 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	OPY2	YPR075C	1083 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	PBI1	YPL272C	1554 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	STB2	YMR053C	2553 nt		4.52	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	VID30	YGL227W	2877 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	CTS1	YLR286C	1689 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	KIN28	YDL108W	921 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	RPL34A	YER056C-A	366 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	YGL193C	YGL193C	312 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	MVD1	YNR043W	1191 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	SER3	YER081W	1410 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	RAD16	YBR114W	2373 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	ECM18	YDR125C	1362 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	LAP3	YNL239W	1365 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	TDA11	YHR159W	1515 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	NGL3	YML118W	1518 nt		4.51	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	TSL1	YML100W	3297 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	PUS1	YPL212C	1635 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	SAD1	YFR005C	1347 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	NNK1	YKL171W	2787 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	GDB1	YPR184W	4611 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	RTK1	YDL025C	1863 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	COQ4	YDR204W	1008 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	TRS23	YDR246W	660 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	VMA22	YHR060W	546 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	SDS3	YIL084C	984 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	YIL163C	YIL163C	354 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	TEF4	YKL081W	1239 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	TFS1	YLR178C	660 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	RRG9	YNL213C	645 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	YOR024W	YOR024W	324 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	SPO19	YPL130W	672 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	BMT2	YBR141C	1014 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	KTR3	YBR205W	1215 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	YCL021W-A	YCL021W-A	378 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	TPO2	YGR138C	1845 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	QDR1	YIL120W	1692 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	BRE2	YLR015W	1518 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	ALG11	YNL048W	1647 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	ECM32	YER176W	3366 nt		4.5	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	PGM2	YMR105C	1710 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	LYS21	YDL131W	1323 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	MDL1	YLR188W	2088 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	MAK11	YKL021C	1407 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	YCR101C	YCR101C	549 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	snR7-L	snR7-L	214 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	YEL050W-A	YEL050W-A	192 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	RMR1	YGL250W	726 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	YJR096W	YJR096W	849 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	OSW1	YOR255W	837 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	YPR195C	YPR195C	330 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	LDH1	YBR204C	1128 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	SKM1	YOL113W	1968 nt		4.49	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	SLS1	YLR139C	1932 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	HRK1	YOR267C	2280 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	DED81	YHR019C	1665 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	NUP116	YMR047C	3342 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	IMA3	YIL172C	1770 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	IMA4	YJL221C	1770 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	MSE1	YOL033W	1611 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	YDL012C	YDL012C	324 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	YDL022C-A	YDL022C-A	249 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	SCM3	YDL139C	672 nt		4.48	□□□□□ -1.69
SIP1	P32578	CPR1	YDR155C	489 nt		4.48	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27 ms