Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HOXA10P31260 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXA10P31260 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms