Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-FP30511 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HLA-FP30511 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms